農業の確定申告を頼むなら｜JA・青色申告会・税理士の費用と違い

※本記事はプロモーションを含みます。

農業の確定申告は、全部を自分でやらなくても大丈夫です。

頼み先は大きく4つあります。

無料の国税庁の作成コーナー、JAの記帳代行、青色申告会、税理士です。

どこまで任せるかで、費用は0円から年10万円以上まで変わります。

頼み先4つを、表でくらべる

頼み先	任せられること	費用の目安	向いている人
国税庁の作成コーナー	画面の案内に沿って自分で作る	無料	帳簿はついている人
JAの記帳代行	帳簿と決算書づくり（申告書の作成は別のことが多い）	例：年35,000円〜、5万円台など（JAごとに違う）	帳簿づけが一番つらい人
青色申告会	記帳の指導、決算・申告の相談	例：鹿児島は年14,000円（会ごとに違う）	教わりながら自分でやりたい人
税理士	帳簿づけから申告書の作成・提出まで	個別見積もり	まるごと任せたい人、規模が大きい人

費用の数字は、下の章で出典をつけて説明します。

① 無料でやるなら：国税庁の「確定申告書等作成コーナー」

お金をかけずに済ませたいなら、まずは国税庁の確定申告書等作成コーナーです。

国税庁によると、作成コーナーでは確定申告書のほか、青色申告決算書や収支内訳書も作ることができ、e-Taxで提出できます。

国税庁の令和7年分の手引きでは、「農業所得がある方」のボタンから、青色申告決算書（農業所得用）の入力画面へ進む手順が説明されています。

ただし、作れるのは「帳簿がついていれば」です。

レシートが箱にたまったままだと、ここで手が止まります。

作成コーナーの手順は、農業の確定申告のやり方に5ステップでまとめました。

会計ソフトは「農業用の決算書」が作れるか確かめる

帳簿づけに会計ソフトを使う人は、農業所得用の決算書を作れるかを先に確かめてください。

ソフトによって、対応がまったく違います。

ソフト	農業所得用の決算書	注意点
マネーフォワード クラウド確定申告	作れない（公式FAQ）	帳簿づけには使える。決算書は作成コーナーで作る
freee会計	作れる（2019年1月7日から）	スタンダード・プレミアムのみ。この機能では電子申告できず、印刷して提出。農業以外の事業所得があると使えない

どちらも、2026年10月27日に各社の公式ページで確かめた内容です。

② 帳簿づけを任せるなら：JAの記帳代行

日々の帳簿づけが一番つらい人は、JAの記帳代行があります。

ただし、中身も料金もJAごとに違います。

公式に料金を公開している2つの例を並べます。

	JAグループ岩手	JA上伊那（長野県）
基本の料金	年35,000円〜（税抜・農業総収入の規模で段階的に増える）	初期登録10,000円＋基本料50,000円（税込）
畜産	家畜の管理（育成費用・棚卸など）は年5,000円〜を追加。繁殖・酪農・肥育はすべて対象	ページに記載なし
やること	会計帳簿と決算書を作る（白色・青色・消費税に対応）	決算書・貸借対照表・総勘定元帳を作る
申告書	作成料金は含まれない	決算書をもとに各自で申告書に転記する

畜産農家は、まず自分のJAで「畜産も対象か」を聞いてください。

JAグループ岩手のように畜産向けの料金を決めているところがある一方で、神戸市周辺のJA兵庫六甲のように、記帳代行の対象から畜産を外しているJAもあります。

また、どちらの例も、確定申告書の作成は料金に入っていません。

「どこまでやってもらえるか」と「税理士の報酬は別か」を、申し込む前に確かめておくと安心です。

③ 教わりながら自分でやるなら：青色申告会

青色申告会は、個人事業主などが集まる民間の団体です。

国税庁の資料によると、各地の青色申告会は記帳の指導や税法の説明会などを行っており、平成31年3月時点で約1,800会・約59万人の青色申告者が加入しています。

会費は会ごとに違います。

公式サイトで料金を公開している、鹿児島青色申告会の例を挙げます。

鹿児島青色申告会	金額
入会金	なし
年会費	14,000円
確定申告の時期の個別相談（所得税）	会員4,000円（会員でない人は20,000円）、2回目から1,000円

申告の時期（2月1日〜3月15日）の個別相談は、完全予約制です。

鹿児島青色申告会は記帳代行も行っていて、2025年9月1日時点で利用者は56名、利用料金の平均は年96,370円と公表しています（金額は業務内容に応じて個別に相談）。

近くの会の金額とサービスは、直接聞くのが確実です。

「やり方を教わって、自分でできるようになりたい」人に向いています。

青色申告会とマネーフォワードの比べ方は、青色申告会って入る必要ある？で書きました。

④ まるごと任せるなら：税理士

帳簿づけから申告書の作成・提出まで、まるごと任せられるのが税理士です。

料金は事務所ごとの個別見積もりです。

一例として、ある税理士事務所（さの会計）の公開している料金表では、次のようになっています。

• 確定申告の作成（事業所得）：100,000円〜（税抜）
• 年商500万円未満で記帳も頼む場合：年間10万円程度から（よくある質問より）
• 年商が上がれば、料金も上がる

これは1つの事務所の例で、農業に限った料金ではありません。

農業には、育成中の家畜の費用の扱いや、肉用牛の免税の特例など、農業ならではの決まりがあります。

頼むなら、農業の申告を受けたことがあるかを最初に聞いてください。

税理士の探し方

知り合いに紹介してもらう方法のほかに、無料で税理士を紹介してくれるサービスもあります。

近くに農業に詳しい税理士が見つからないときは、条件を伝えて探してもらう方法もあります。

頼むかどうか、3つの質問で決める

迷ったら、次の3つを自分に聞いてみてください。

1. 1年分の帳簿は、今ついているか？　ついていない → まず記帳代行か税理士
2. 畜産の収入はあるか？　ある → JAに畜産が対象か聞く。対象外なら税理士
3. 申告の時期に、何日も時間をとれるか？　とれない → 税理士

反対に、帳簿がついていて時間もとれるなら、無料の作成コーナーで十分です。

頼む前に、これだけは確かめる

費用の総額：月額か年額か。登録料・事務用品代・税理士報酬は別か。

どこまでやるか：帳簿づけだけか、申告書の作成と提出までか。

やめ方：途中でやめるときの決まり。

農業の経験：農業所得の申告を受けたことがあるか。

よくある質問

Q. 農業の確定申告は、自分でやらないといけませんか？

A. いいえ。

帳簿づけはJAの記帳代行、申告書の作成は税理士に頼めます。

費用はかかるので、総額を確かめてから決めてください。

Q. お金をかけずに済ませる方法はありますか？

A. 国税庁の確定申告書等作成コーナーは無料で、青色申告決算書（農業所得用）も作れます。

ただし、帳簿がついていることが前提です。

Q. マネーフォワードで農業の決算書は作れますか？

A. 公式FAQによると、青色申告決算書（農業所得用）と収支内訳書（農業所得用）の作成には対応していません。

帳簿づけに使い、決算書は作成コーナーで作る形になります。

Q. JAの記帳代行は畜産農家も使えますか？

A. JAによって違います。

JAグループ岩手は繁殖・酪農・肥育向けの料金を決めていますが、JA兵庫六甲は対象を「農業収入（畜産除く）」としています。

自分のJAに確かめてください。

まとめ

• 頼み先は、作成コーナー（無料）・JAの記帳代行・青色申告会・税理士の4つ
• JAの記帳代行は、JAごとに料金も中身も違う。畜産向けの料金があるJAも、畜産が対象外のJAもある
• 会計ソフトは、農業所得用の決算書を作れるか先に確かめる
• まるごと任せるなら税理士。農業の申告を受けたことがあるかを最初に聞く

自分でやる手順は農業の確定申告のやり方に、白色申告の書き方は収支内訳書（農業所得用）の書き方にまとめています。

📚 参考・出典

すべて2026年10月27日に開いて確認しました。

• 国税庁「確定申告書等の作成｜令和7年分 確定申告特集」 ── 作成コーナーで確定申告書・青色申告決算書・収支内訳書を作成し、e-Taxで提出できる
• 国税庁「令和7年分 決算書作成（青色申告）編」の手引き（PDF） ── 「農業所得がある方」ボタンから「決算書（農業所得用）の入力」画面へ進む
• マネーフォワード クラウド確定申告 サポート（2026年9月4日更新） ── 青色申告決算書（農業所得用）・収支内訳書（農業所得用）の作成に非対応
• freee ヘルプセンター「freee会計マニュアル【農業（個人事業主）の経理編：確定申告】」（2026年4月6日更新） ── 2019年1月7日から農業所得用の決算書を作成可・スタンダード／プレミアムが対象・この機能では電子申告不可・65万円控除の決算書は出力不可・農業以外の事業所得は対応不可
• JA兵庫六甲「記帳代行サービス」 ── 対象は農業収入（畜産除く）または不動産収入のある組合員・申告書の作成は行わない
• JAグループ岩手「会計記帳代行＆申告事務支援」案内資料（PDF・作成時期の記載なし） ── 個人農家の会計記帳代行基本 年35,000円〜（税抜・農業総収入で段階的に増額）・飼養家畜管理 年5,000円〜（繁殖・酪農・肥育経営を行う全ての者が対象）・確定申告書の作成料金は含まない・年間料金は必要経費に算入できる
• JA上伊那「記帳代行サービス」 ── 個人：初期登録料10,000円・基本料50,000円（税込）・決算書等を作成し各自で申告書に転記
• 国税庁「第1節 関係民間団体」 ── 単位青色申告会は記帳指導・税法説明会などを行う／約1,800会・約59万人（平成31年3月）
• 鹿児島青色申告会「記帳代行サービスを利用してみませんか？」（2026年3月23日） ── 2025年9月1日時点で利用者56名・平均年96,370円・費用は業務内容に応じて個別相談
• 鹿児島青色申告会「料金案内」 ── 入会金なし・年会費14,000円・確定申告期個別相談（所得税）会員4,000円／非会員20,000円・2回目以降1,000円・2/1〜3/15完全予約制
• さの会計「料金表」 ── 事業所得の確定申告100,000円〜（税抜）・年商500万円未満で年間10万円程度から